Το Βυζαντινό Μουσείο Καστοριάς ιδρύθηκε το 1989 και στεγάζει μια από τις μεγαλύτερες ελληνικές συλλογές βυζαντινών και μεταβυζαντινών εικόνων του Υπουργείου Πολιτισμού. Στο μουσείο εκτίθενται φορητές εικόνες αλλά και τοιχογραφίες καστοριανών ναών, ψηφιδωτά της Διοκλητιανούπολης (Άργος Ορεστικό) και αρχιτεκτονικά γλυπτά (παλαιοχριστιανικά, βυζαντινά και οθωμανικά) προερχόμενα από διαφορετικές θέσεις του νομού Καστοριάς, εκκλησιαστικά ξυλόγλυπτα και βιβλία από τους ναούς της πόλης, κεραμική και νομίσματα.
Το Βυζαντινό Μουσείο Καστοριάς διαθέτει δύο μεγάλες αίθουσες 200 τ.μ. και μια μικρότερη 80 τ.μ. Ο χώρος είναι διαρθρωμένος σε έξι ενότητες: η πρώτη περιλαμβάνει έργα του 12ου-13ου αιώνα, η δεύτερη έργα του 14ου -15ου αι., η τρίτη του 15ου αι., η τέταρτη 16ου και 17ου αι., η πέμπτη έργα της κρητικής σχολής και η έκτη έργα των 15ου και 16ου αι. στη φάση της συντήρησής τους.